阴蒂肥大的治疗通常以作阴蒂大部分切除，适当保留阴蒂头部或作阴蒂部切除术，通常于阴蒂北部作切口，大部切除阴蒂体部，阴蒂头部仍宜作适当保留，以注意保护女士的性敏感区。术后应注意阴部清洁及留置尿管，以使伤口早日痊愈和预防感染。同时，术后常规应用有效抗生素以防治感染。
阴蒂整形术前应作一些必要的检查，有时需要检测激素水平，查盆腔B超等，在明确病因或排除其他必须先予治疗的重要疾患后即可实施手术。术前应清洁外阴，停止吸烟一周以上，停用可能造成凝血功能障碍的药物，手术须避开月经期。
手术的目的是缩小阴蒂，但要保留部分阴蒂头，并保证其血循环和神经支配不受破坏，避免影响术后性生活的满意度。手术时先切开阴蒂体部的皮肤，剥离后充分暴露海绵体，寻找位于阴蒂背侧的血管神经束并予以保护，切除阴蒂体部的海绵体和部分阴蒂头适宜大小，修剪皮肤后缝合。阴蒂整形术的关键是一定要保护好支配阴蒂头的血管神经束的完整性，以确保保留的阴蒂头不仅成活，而且存在良好的感觉。以往，有些术式只强调术后外形，虽然达到了缩小的目的，但却丧失了阴蒂的感觉，因而是不可取的。患者在手术前应当了解手术方法、手术的效果，以作出正确的选择。
